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原创与跟风----国内首次发现两株新细菌

已有 2770 次阅读 2014-2-13 08:35 |个人分类:科技查新|系统分类:科研笔记



       科研成果是否国内、国际首次发现、首例报告?是科技查新必须明确回答的问题,可以通过文献数据库的全面检索,分析相关文献,核对密切相关文献,作出肯定或否定的查新结论。

       至于该项科研成果的先进性、实用性、科学性、是否为原创、科学意义和价值、学术水平等,由学科同行专家去评议确认。

       作为该项研究的科研人员,在课题研究前、中、后应该对国内外的研究的历史、现状与发展搞的一清二楚,心中有数。

       国内外有很好的文献信息分析系统或信息平台,从文献信息的分布规律,确定需要进一步查阅分析的文献,可以大大节省科研人员和查新人员的时间和精力。

       临床研究课题应该检索临床试验数据库,如http://clinicaltrials.gov/。基础生物医学研究课题大多数在分子生物学水平进行研究,应该检索NCBI数据库,如基因库 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/


       近日,首都医科大学宣武医院检验科细菌室应用分子生物学技术和质谱技术,鉴定出两例国内首次发现的菌种。

       一例是在血流感染(败血症和菌血症)患者血培养中分离出的Rothia aeria。该菌2004年从俄罗斯空间站的水和空气中被首次分离和鉴定,并由此命名,迄今为止很少引起人类感染,全球共6例报道,此例在国内为首例报道。

       另一例是在尿路感染患者尿液中,分离鉴定出Candida nivariensis,为国内首次报道该菌引起尿路感染病例。

       这两种菌用常规鉴定方法无法准确鉴定。该院检验科运用质谱仪和分子生物学测序的方法和系统发育分析方法,确定出了细菌的种属。据悉,该院已将所测序列申请国际权威的基因库GenBank,并在国际各大基因库同时发布。登录号分别为KF691779和KF410863。(生物谷Bioon.com)

 http://www.bioon.com/3g/id/591225/ 

检索分析平台  http://www.pubmedplus.cn/Pubmed/LoadStatistic

Rothia aeria研究文献分析结果如下:

字段:国家
记录数
占%
01.日本    3 27.273%
02.美国    3 27.273%
03.新西兰    1 9.091%
04.英国    1 9.091%
05.澳大利亚    1 

9.091


字段:主题词
记录数
占%
01.micrococcaceae    6 54.545%
02.anti-bacterial agents    5 45.455%
04.microbial sensitivity tests    3 27.273%
05.actinomycetales infections    3 27.273%
06.phenotype    2 18.182%
07.rna, ribosomal, 16s    2 18.182%
08.molecular sequence data    2 18.182%
09.sepsis    2 18.182%
10.lung diseases    2 

18.182

字段:作者缩写
记录数
占%
01.Helmerhorst EJ    2 18.182%
02.Wei G    2 18.182%
03.Oppenheim FG    2 18.182%
04.Ohkusu K    2 18.182%
05.Schuppan D    2 18.182%
06.Balendra A    1 9.091%
07.Blumenkranz G    1 9.091%
08.Cattoir V    1 9.091%
09.Dewhirst FE    1 9.091%
10.Crowe A    1 

9.091

字段:机构
记录数
占%
02.kawasaki medical school    1 9.091%
06.hamanomachi hospital    1 9.091%
09.wellington hospital    1 9.091%
10.gifu university    1 

9.091

字段:期刊
记录数
占%
01.Infection    2 18.182%
02.J Clin Microbiol    2 18.182%
03.PLoS One    1 9.091%
04.Int J Syst Evol Microbiol    1 9.091%
05.J Clin Immunol    1 9.091%
06.BMJ Case Rep    1 9.091%
07.Intern Med    1 9.091%
09.Clin Microbiol Infect    1 

9.091

字段:年份
记录数
占%
01.2010    3 27.273%
02.2013    3 27.273%
03.2012    2 18.182%
04.2011    1 9.091%
05.2004    1 9.091%
06.2009    1 9.091%








Rothia aeria (284)

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/?term=Rothia+aeria

Rothia aeria strain B473-478 16S ribosomal RNA gene, partial sequence

GenBank: KF691779.1

FASTA Graphics

详细数据见  http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/KF691779

 

Candida nivariensis 研究文献分析结果如下:

字段:国家
记录数
占%
01.西班牙    8 28.571%
02.英国    3 10.714%
03.法国    3 10.714%
04.美国    3 10.714%
05.泰国    2 7.143%
06.意大利    2 7.143%
07.印度    2 7.143%
08.印尼    1 3.571%
09.澳大利亚    1 3.571%
10.伊朗    1 3.571%
11.日本    1 3.571%
12.阿根廷    1 

3.571

字段:主题词
记录数
占%
01.candida    23 82.143%
03.candidiasis    17 60.714%
04.antifungal agents    10 35.714%
05.dna, fungal    10 35.714%
07.polymerase chain reaction    9 32.143%
08.dna, ribosomal    9 32.143%
10.drug resistance, fungal    8 28.571%
11.dna, intergenic    8 28.571%
12.dna, ribosomal spacer    7 25.000%
13.sequence analysis, dna    7 25.000%
14.fungemia    6 21.429%
15.phylogeny    5 17.857%
16.rna, ribosomal    5 17.857%
17.molecular sequence data    4 14.286%
18.candidemia    4 14.286%
19.phenotype    4 14.286%
20.hospitals    4 14.286%
21.mycology    4 14.286%
22.blood    3 10.714%
23.candida glabrata    3 10.714%
24.dna primers    3 10.714%
25.prospective studies    3 10.714%
27.species specificity    3 10.714%
28.azoles    3 10.714%
29.base sequence    2 7.143%
30.carrier state    2 7.143%
31.dna fingerprinting    2 7.143%
33.prevalence    2 7.143%
34.urine    2 7.143%
36.fluconazole    2 7.143%
37.genes, fungal    2 7.143%
38.hiv infections    2 7.143%
39.cluster analysis    1 3.571%
40.culture media    1 3.571%
44.abscess    1 3.571%
45.dna, bacterial    1 3.571%
46.feces    1 3.571%
47.fruit    1 3.571%
49.genes, rrna    1 3.571%
50.limit of detection    1 

3.571

字段:作者缩写
记录数
占%
01.Merz WG    3 10.714%
02.Bishop JA    3 10.714%
03.Quindós G    3 10.714%
04.Borman AM    2 7.143%
05.Boekhout T    2 7.143%
06.Cano J    2 7.143%
07.Enache-Angoulvant A    2 7.143%
08.Chase N    2 7.143%
09.Alcoba-Flórez J    2 7.143%
10.Guitard J    2 7.143%
11.Chowdhary A    2 7.143%
12.Criseo G    2 7.143%
13.Eraso E    2 7.143%
14.Durrens P    2 7.143%
15.Fairhead C    2 7.143%
16.Guarro J    2 7.143%
17.Hennequin C    2 7.143%
18.Kaewwichian R    2 7.143%
19.Limtong S    2 7.143%
20.Johnson EM    2 7.143%
21.Meis JF    2 7.143%
22.Kurtzman CP    2 7.143%
23.Martin T    2 7.143%
24.Méndez-Alvarez S    2 7.143%
25.Miranda-Zapico I    2 7.143%
26.López-Soria LM    2 7.143%
27.Hernández-Almaraz JL    2 7.143%
28.Pérez-Roth E    2 7.143%
29.Randhawa HS    2 7.143%
30.Romeo O    2 7.143%
31.Yongmanitchai W    2 7.143%
32.Alcoba J    1 3.571%
33.Almeida Cruz J    1 3.571%
34.Allaouchiche B    1 3.571%
35.Argaud L    1 3.571%
36.Arendrup MC    1 3.571%
37.Atanasova R    1 3.571%
38.Arévalo Mdel P    1 3.571%
39.Bastien O    1 3.571%
40.Almirante B    1 3.571%
41.Am-In S    1 3.571%
42.Aguileta G    1 3.571%
43.Arnaise S    1 3.571%
44.Bereciartua E    1 3.571%
45.Ahmad S    1 3.571%
46.Bienvenu AL    1 3.571%
47.Borrell N    1 3.571%
48.Boisnard S    1 3.571%
49.Bouchier C    1 3.571%
50.Bolotin-Fukuhara M    1 

3.571

字段:机构
记录数
占%
02.university of delhi    2 7.143%
05.kasetsart university    2 7.143%
06.royal free hospital    1 3.571%
10.kanazawa university    1 

3.571

字段:期刊
记录数
占%
01.J Clin Microbiol    9 32.143%
02.Med Mycol    3 10.714%
03.J Antimicrob Chemother    2 7.143%
04.Antonie Van Leeuwenhoek    1 3.571%
05.BMC Genomics    1 3.571%
06.J Mol Diagn    1 3.571%
07.Med Mycol Case Rep    1 3.571%
08.Mycopathologia    1 3.571%
09.PLoS One    1 3.571%
14.J Microbiol Methods    1 3.571%
15.Res Microbiol    1 3.571%
16.Rev Iberoam Micol    1 3.571%
17.Mycoses    1 

3.571

字段:年份
记录数
占%
01.2011    7 25.000%
02.2013    7 25.000%
03.2008    4 14.286%
04.2012    3 10.714%
05.2009    2 7.143%
06.2005    2 7.143%
07.2010    1 3.571%
08.2007    1 3.571%
09.2014    1 3.571%








http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/?term=Candida+nivariensis

 

Candida nivariensis strain FC531 internal transcribed spacer 1, partial sequence; 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2, complete sequence; and 28S ribosomal RNA gene, partial sequence

GenBank: KF410863.1

FASTA Graphics

详细数据见  http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/KF410863

 









https://wap.sciencenet.cn/blog-280034-767040.html

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