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本体语言支持的信息平台

已有 3008 次阅读 2013-10-13 09:06 |个人分类:知识组织|系统分类:科研笔记| 信息

     

   本体语言比传统的分类法、主题法组织的知识体系更为科学、精细,信息检索和知识发现更为全面、精确。国内利用本体词表建立了一些数据库和信息平台(医学系统也有了),但与国际先进的信息平台比,有较大的差距。

医学本体(Medical Ontology,MO):基因本体、疾病本体、药物本体、卫生本体、中医本体、中药本体等。

(系列博文  http://blog.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=280034&do=blog&view=me&classid=114878&from=space&page=3

基因本体(Gene Ontology,GO)是一个在生物信息学领域中广泛使用的本体。它主要包括三个分支: 生物过程、分子功能和细胞组件。

1  基因本体信息平台

在这个信息平台上可以免费检索、浏览、过滤基因和蛋白质的精确信息和知识。

基因本体数据库 the Gene Ontology database

http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/search.cgi?action=advanced_query&session_id=4363amigo1381624861

2   基于本体的医学信息检索分析平台 (Coremine Medical)  http://blog.sciencenet.cn/blog-280034-623551.html

这是挪威开发的生命科学信息平台,可以检索和分析基因和蛋白质详细信息,有强大的语义网支持和信息导航和链接。http://www.coremine.com/medical/?locale=zh_CN#search?ids=49562&tt=8191&org=hs&t=TERM&i=4956

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3  GOPUBMED生物医学信息检索与分析平台

这是德国2007年开发的信息平台,有基因(GO)本体信息分析和过滤,与医学主题词(MH)的文献信息相区分,这是与PUBMED系统的一个重要区别,具有精确的信息分析功能。http://gopubmed.org/web/gopubmed/

4  PUBMEDPRO检索与分析平台

这是国内开发整合的信息平台,有基因和蛋白质本体信息过滤功能。

http://www.pubmedpro.cn/?term=aids%20%20hiv%20

5  PUBMEDPLUS 生物医学分面检索与聚类分析系统

这是国内开发的信息检索与分析系统,具有强大的信息过滤和聚类分析功能,基因和蛋白质本体信息分析全面、准确,精细。http://www.pubmedplus.cn/

 


 



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