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简化lefse图流程

已有 372 次阅读 2021-8-31 09:36 |个人分类:生物信息学|系统分类:科研笔记


参考http://blog.sciencenet.cn/blog-3334560-1161388.html


1)删除非marker物种,保留marker物种,格式如下

1.png

                                               

2)替换k__等,格式修改为如下,另存为.txt格式,然后修改为.lefse_internal_res

2.png

3.png

 

3)打开网址http://huttenhower.org/galaxy/,选择lefse_internal_res类型,上传数据

4.png

 

4)点击 C) Plot LEfSe Results进行后续分析即可。

5.png

 




http://wap.sciencenet.cn/blog-2675068-1302159.html

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