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GGE 的意思是在主成分分析时, 分解的是G+GbyE,然后根据PC1和PC2作双标图,称为GGE Biplot。
单纯的将PC1和PC2投射到双标图中,标清楚品种和地点。
从中心到各个环境做一条线段,主要是评价环境的区分性和相似性。
which won where
这张图主要是按照品种与环境的互作来说明各地点产量最高的品种。
理想的试验点应该具备两个条件:一是对参试品种有较强的区分能力(线段长),二是对目标生态区有较强的代表性。这里带箭头的为平均环境轴。
根据平均环境轴,画同心圆,地点所处的圆越小,说明地点的区分性和代表性越强,说明地点越好。
根据平均环境轴作同心圆,如果品种所在的圈越小,说明品种的丰产性(产量)和稳定性(互作)越好,说明该品种越好。
该图和1.6的品种排名一样,反应的是品种的丰产性和稳定性。
head(dat)
cul_mean = aggregate(yield~ gen,data=dat,mean)
cul_mean[order(cul_mean$yield),]
env_mean = aggregate(yield~ env,data=dat,mean)
env_mean[order(env_mean$yield),]
cv = function(dd){
mm = mean(dd)
vv = sd(dd)
cv = vv/mm
return(cv)
}
gen_cv = aggregate(yield ~ gen, data=dat, cv)
gen_cv[order(gen_cv$yield),]
env_cv = aggregate(yield ~ env, data=dat, cv)
env_cv[order(env_cv$yield),]
严威凯. 双标图分析在农作物品种多点试验中的应用[J]. 作物学报, 2010, 36(11):1805-1819.
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