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最近支持尿液标志物两篇文章

已有 1647 次阅读 2020-12-15 17:29 |系统分类:论文交流

一篇是蛋白质组学领域的大牛,德国马普的Matthias Mann课题组的预印本Urinary proteome profiling for stratifying patients with familial Parkinsons disease10.1101/2020.08.09.243584)。先说这篇文章的结论,帕金森病和健康人的尿蛋白质组是显著不同的;包含两种不同遗传突变组合的帕金森疾病类型的尿蛋白质组也是显著不同的。

这个结论支持了我们一直宣传的尿蛋白质组能够敏感地区分不同疾病不用亚型以及不同疾病状态。

再说证据的强度,两个中心,每个中心分四组,每组都有16-40个病人或者正常对照的样本,每个样本都是单独进行了高质量的蛋白质组学分析。蛋白质组学分析的整体质量应该说无可挑剔。数据统计和机器学习,验证应该足够专业,超过了我能评价的范围。

挑一点毛病,病人未必是早期的帕金森,应该是通过其他临床指标做了诊断的病人。也就是说现在找到的尿蛋白质组线索,只是提供了另一个客观指标,并且为找到疾病相关的病理生理有帮助。文章引用了我们实验室写的一篇综述,只是说脑子的疾病可以在尿液中反映。而没有强调我们最想说的尿液是更早期的疾病标志物的来源。

另一个比较大的问题,甚至是可能动摇文章基础的问题,是没有说明病人是不是在用药物治疗,而健康对照是不是没有用同样的或者类似的药物。如果没有在文章中提到,根据伦理,我猜测有些病人可能正在用药,而健康人非常可能没有用同样的药物。这样的话,疾病和药物的作用就交织在一起,得到的差别还不敢肯定一定都是疾病的影响。因为我们研究过的药物都对尿蛋白质组有一定的影响。这其实的临床研究的很难克服的固有困难之一,虽然很多研究者都认为临床研究比动物实验更加高级更接近实用。在得结论方面,动物模型更容易给出明确的结论,虽然离临床应用还有距离。

第二篇文章是日本科学家Takaya Shimura领导的包括中国美国科研人员参加的胃癌诊断的研究,文章发表在British Journal of Cancer10.1038/s41416-020-01063-5),题目是Novel urinary protein biomarker panel for early diagnosis of gastric cancer

先说一下文章的结论,他们找到的尿蛋白组合可以比较满意地区分一期的早期胃癌和健康人。

这个结论支持我们一直宣传的尿液可以反映疾病的早期,是早期标志物的理想来源的说法。

再说一下证据的强度,多个国家参与,总共300+病人和对照,大量一期胃癌病人样本,考虑到了年龄,性别,幽门螺旋菌和组织学区别。

缺点是采用的是先混合样本再定量分析的策略。这个策略人为地缩小的组内的差异,使得更容易发现组间的差异,但是差异的可信度肯定会有所降低。文章也没有明确各组病人的用药的情况。这些假定药物对尿蛋白质组没有影响,只有疾病对尿蛋白质组有影响的假设不能成立。

总体上两篇文章虽然在实验设计上还都有些问题,但是都对尿蛋白质组的诊断潜力给出了正面的预期。能受到国际上更多科研人员的重视,总归是一个值得高兴的好现象,是领域发展的一个进步。




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