科学为人类提供了丰富的物质，宗教安慰了人类的心灵，政治为人类提供了一个稳定的秩序。科学、宗教与政治互相影响，相互渗透，相互促进。有时，三者又相互掣肘。究竟什么样的关系才是合理的？历史的经验与教训告诉我们：宗教归宗教，政治归政治，科学归科学；上帝归上帝，凯撒归凯撒，牛顿归牛顿；也即是说：政治与宗教分离，政治与科学分离，宗教与科学分离；亦即：政教分离，政科分离，宗科分离，对我们的社会最有利。

科学是人类探索自然界万物变化规律的，是揭示自然界隐藏的奥秘的。科学要求其假说是可以检验的。科学要求真实，杜绝虚假。科学给人类社会带来的益处数不胜数。吃穿住行无所不包。科学技术的进步极大地提高了了粮食的产量，人造纤维的发明解决了人类的穿衣问题，钢筋水泥混凝土的发明使高楼大夏成为现实。自行车、汽车、火车、轮船和飞机给人类的出行带来了极大的便利。电灯照亮了世界。宗教是信仰，相信现实世界之外存在着上帝，对其所信仰的神圣对象和教理教义由崇拜认同而产生的坚定不移的信念及全身心的依从，并用来指导和规范自己在世俗社会中的行为。宗教信仰使人类变得互敬互爱与和睦相处。宗教使人类有所畏惧，多做好事少做坏事。政府维护了正义公平。

在历史上，宗教与政治结合，发动了许多次的宗教战争，给人类带来了巨大的灾难。由此，人类认识到宗教必须与政治分开，政治不干涉宗教，宗教不能干涉政治。政教分离成为人类社会的一项原则。尽管世界上仍然存在政教不分的国家，但必定是少数了。

在历史上，宗教与科学既有相遇与互渗、亦有碰撞与分离,其关系错综复杂。一方面，宗教促进了科学的发展。许多科学家就是神父，著名的有哥白尼，孟德尔等等。另一方面，宗教阻遏科学发展，著名的例子是布鲁诺被宗教裁判所烧死。由于宗教主张信仰，科学主张真实，二者存在矛盾。如何处理这种矛盾，答案是把宗教信仰与科学研究分开，宗教与科学分离。现实中看到许多客人拿科学攻击宗教，这是不应该的。宗教是信仰！是维护社会互爱的，是不应该拿科学观点去衡量的。科学的观点不能作为衡量宗教道德的标准！

历史上，科学研究曾经是个人行为，仅仅得到私人的资助。今天，政府已经是科学研究的主要资助来源。但是由于科学研究是一种基于个人兴趣的探索行为，政府在具体科学研究上的一些干预反而会阻遏科学的发展，这一点也应该认识到。

因此政教分离，科教分离，政科分离，应该是政治、科学和宗教的基本原则。